네트워크 구조의 변화는 모든 관계구조를 변화시키고, 이는 다시 부분과 전체의 관계를 변화시킨다. 대개 학문은 부분과 전체의 관계에 대해서 다룬다. 경제학도 예외가 아니어서 수많은 개별 경제 주체들의 미시적 행위의 결과 나타나는 거시적 질서를 규명한다. 즉 경제행위에 있어서 부분과 전체의 관계를 다룬다. 실로 부분과 전체의 관계는 매우 복잡하고 오묘하다. 그러나 지금까지 경제학의 주류는 이를 너무 단순화시켜 이론을 전개하여 왔다. 실제 경제 현상은 그리 단순하지 않고 복잡하여 이론과 현실 간의 간극이 항상 존재하여 왔다. 물론 단순화시키지 않고서는 이론을 발전시키는 데 한계가 있다는 점 또한 이해가 되지만 그런 이유로 기존 패러다임에 내내 갇혀 있을 수만은 없다. 끊임없이 패러다임을 새롭게 하여 이론과 실제 간의 간극을 좁혀야 할 것이다. 네트워크 경제학은 이러한 한계를 극복하고자 하는 노력의 하나로 이해될 수 있다.
